Durant cette période (1852-1878), le Collège, dirigé par divers laïcs, est à la fois un gymnase public, une école de filles et un institut helvétique de langues et de commerce, avec des fortunes diverses.
Lors de la création de l'Administration apostolique du Tessin en 1885 (diocèse de Lugano depuis 1971), le pape Léon XIII confia aux administrateurs apostoliques (évêques) de Lugano le Collège qui, entre-temps, était redevenu dirigé par un curé tessinois, Don Alessandro Verda.
Deux ordres religieux se succèdent à la direction : les Salésiens de 1894 à 1910 et les Assomptionnistes de 1910 à 1917.